Σταθερή διατηρείται η προσπάθεια της διοίκησης του ΕΟΠΥΥ, να περιορίσει τις καταχρηστικές δαπάνες, οι οποίες διασπάθιζαν δημόσιο χρήμα σε άσκοπες συνταγογραφήσεις. Η κατηγορία των Σκευασμάτων Ειδικής Διατροφής, αποτελεί ένα χαρακτηριστικό παράδειγμα το οποίο μάλιστα εν μέσω κρίσης άνθισε. Τα στοιχεία του οργανισμού δείχνουν ότι ενώ η δαπάνη για σκευάσματα το 2013 είχε διαμορφωθεί στα 11,45 εκατ. ευρώ, αυτή εκτινάχθηκε το 2016 στα 46,36 εκατ. ευρώ. Πλέον με βαση το προϋπολογισμό του 2018, υπάρχει κλειστος προϋπολογισμός για την κατηγορία ο οποίος φτάνει στα 16,5 εκατ. ευρώ
 
Η παραπάνω αύξηση των εν λόγω δαπανών, αποδίδεται σε σκανδαλώδεις συνταγογραφήσεις που επιβάρυναν τα ταμεία του ΕΟΠΥΥ. Σύμφωνα μάλιστα με την παρουσίαση «Κατηγοριοποίηση, ηλεκτρονική συνταγογράφηση και στατιστική   ανάλυση της συνταγογράφησης σκευασμάτων ειδικής διατροφής (ΣΕΔ) με σκοπό την πρόληψη της υπερσυνταγογράφησης» η οποία δημοσιοποιήθηκε στο πλαίσιο του πρόσφατου συνεδρίου της ΕΣΔΥ, χαρακτηριστικό είναι το παράδειγμα για σκευάσματα υποθρεψίας και δυσαπορρόφησης, που συνταγογραφηθηκαν κατά χιλιάδες το Μάρτιο του 2015. Συγκεκριμένα, μόνο για εκείνο το μήνα, 15.000 τέτοια σκευάσματα υποβλήθηκαν για αποζημίωση από τον ΕΟΠΥΥ, και μάλιστα μόνο στην Αλεξανδρούπολη! 
 
Στην παρουσίαση, την οποία υπογράφουν οι κ.κ. Μπερσίμης Σωτήρης, Πρόεδρος ΕΟΠΥΥΒαφειάδης Ιωάννης, τ. Γεν. Διευθυντής ΕΟΠΥΥ και Ζαχαρόπουλος Κωνσταντίνος, γιατρός ΕΟΠΥΥ, φαίνεται ξεκάθαρα η αυξητική τάση των δαπανών για σκευάσματα ειδική διατροφής. 
Συγκεκριμένα το 2012 η δαπάνη ήταν 12 εκατ. ευρώ, το 2013 ήταν 11,35 εκατ. ευρώ, το 2014 ήταν 21,56 εκατ. ευρώ, το 2015 ήταν 34,59 εκατ. ευρώ και το 2016 διαμορφώθηκε στα 46,36 εκατ. ευρώ. Μάλιστα όπως φαίνεται από τα στοιχεία, η εκτίναξη αποδίδεται στα σκευάσματα δυσαπορρόφησης, καθώς από δαπάνη 5,64 εκατ. ευρώ το 2013, ήτοι το περίπου 50% του συνόλου, εκτοξεύτηκαν στα 37,63 εκατ. ευρώ το 2016 δηλ. στο 81% της συνολικής αξίας σκευασμάτων. 
 
Για το 2017 τα στοιχεία δεν έχουν γνωστοποιηθεί, ενώ για την τρέχουσα χρονιά, ο ΕΟΠΥΥπροσδιόρισε τη δαπάνη στα 16,5 εκατ. ευρώ  (κλειστός προϋπολογισμός) και παράλληλα προϋπολόγισε και άλλα 13 εκατ. ευρώ για την κάλυψη δαπάνης το 2017. Επίσης στον προϋπολογισμό υπάρχει και πρόβλεψη για clawback  της τάξης των 13 εκατ. ευρώ. Στόχος του ΕΟΠΥΥ είναι η εξοικονόμηση τουλάχιστον 20 εκατ. ευρώ κατ’ έτος.